非瘟、蓝耳变异重组？张桂红：构建宏基因组测序平台，实现复杂猪病的全面诊断与精准防控

11月3日-5日，第五届（2024）新猪派养猪产业峰会在温氏总部所在地、“六祖故里”云浮新兴隆重举行。本次大会以“创新质·增效率”为主题，汇集国内养猪产业行业专家、TOP50猪企“掌舵人”和产业链上下游业界精英，共同探索如何通过科技创新提升新质生产力，推动养猪行业增产提效，实现更加绿色、高效、可持续的发展。

华南农业大学兽医学院教授张桂红在会上分享了《宏基因组测序在养猪一线的应用》主题报告。她表示，宏基因组测序方法在临床复杂的猪病环境条件下，通过对结果的有效分析，可以确定猪场是否存在混合感染、病原毒株类型及变异、重组情况，从而精确的做出治疗与防控方案，也可以排查猪场的管理问题。

华南农业大学兽医学院教授张桂红

本次大会由新猪派、华南农业大学乡村振兴与社会服务处联合主办，华农农梓乡村振兴产业研究中心承办，温氏股份和勃林格殷格翰联合举办。新猪派特邀近100位权威专家和行业龙头企业嘉宾，以及部分万头能繁母猪企业和业内优秀养殖企业嘉宾400余人参会，总养殖规模覆盖超400万头母猪，共同围绕创新发展、成本优化、效率提升等话题展开讨论，共同寻觅存量时代下中国农牧企业的破局之道。

高通量测序：

养猪一线的新利器

在养猪一线，疾病的防控一直是养殖者最为关注的问题之一。在面对复杂的猪病感染时，如何快速的判断出病原是至关重要的，而基因测序正是实现这一目标的重要手段之一。当前的测序方法包括一代（Sanger测序法）、二代（高通量测序）和三代（纳米孔测序）。一代测序，即经典的Sanger测序法，以其高准确度和长读长著称，是早期基因研究的重要工具，但Sanger法难以覆盖所有可能的病原体，随着高通量测序技术在生命科学和医学领域的日益广泛应用，这一先进技术已被成功引入养猪业的疾病防控中，在了解猪场病原感染情况具有一定的意义。

在ASFV、PRRSV以及腹泻类疫病和临床复杂的疫病环境条件下，通过高通量测序并对结果进行分析，可以判读感染病原的毒株类型及变异、重组情况，猪场混合感染情况，预估毒株致病性，同时也可以排查猪场的管理问题。

张桂红教授还分享了她们课题组的高通量测序平台，并鼓励大型养殖集团建立自己的测序平台以提升疫病防控能力。然而，对于小养殖户而言，由于建设测序平台成本较高，建议将测序工作交由专业的检测公司来完成。

疫病是当今猪企降低成本路上最大的“拦路虎”。在养猪业中，非洲猪瘟和猪蓝耳病的防控尤为重要。这两种疾病都具有高度的接触传染性，可以引发免疫抑制，导致猪群整体健康水平下降，生产效益受损。除此之外，ASFV、PRRSV容易发生重组变异，复杂性和威胁性日益凸显。

在这一背景下，宏基因组测序技术凭借其测得多、测得快的优势，得到了广泛应用。它通过对检测样本中的基因进行打断、扩增、捕获和测序，然后与数据库进行对比，就可以分析出样本中含有什么病原体。这种技术不仅适用于已知病原体的检测，还能发现未知病原体，从而实现对病原体的全面检测。

养猪集团可借此技术建立报告体系，通过比较不同时间点病毒株的差异，及时发现生物安全漏洞，排查新病原体入侵风险。此外，宏基因组测序还能鉴别野毒与疫苗毒，评估毒性及混合感染情况，为疫病防控提供有力支持。

健康体检是对猪群进行的一种全面体检方式，通过收集不同群体的样品，利用宏基因测序技术，可以鉴定出细菌、病毒、寄生虫及真菌等多种病原。目前张桂红教授团队的测序平台已经能够一次性建立多个模块，识别出大约70多种常见的病毒和细菌，并对其进行分型、鉴定血清型，同时鉴定耐药基因。

现场嘉宾认真听讲

本次大会还得到了温氏食品集团股份有限公司、江苏勃林格殷格翰生物制品有限公司、硕腾（上海）企业管理有限公司、金宇生物技术股份有限公司、天津瑞普生物技术股份有限公司、合肥拉塞特机器人科技有限公司、宁波三生生物科技股份有限公司、浙江海正动物保健品有限公司、佛山市正典生物技术有限公司、浙江康牧动物保健股份有限公司、南牧装备科技有限公司、华威特（江苏）生物制药有限公司、广东广垦畜牧集团股份有限公司、青岛瑞尔唯特生物技术有限公司、海博莱·中国、江苏南农高科技股份有限公司、江西加大集团有限公司、史记生物技术有限公司、广州朴成生物科技有限公司、广东永顺生物制药股份有限公司、重庆国猪大健康科技有限公司、宁波科瑞特动物药业有限公司、山东鲁抗舍里乐药业有限公司、江西成必信生物科技股份有限公司、上海蒂默曼生物科技有限公司、自然集團（中國）有限公司……等30多家国内外优秀企业的大力支持！

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